Ciencia abierta 2023

(00:01) si quieres comenzar ya a grabar y voy a quitar mi vale se ve correctamente la pantalla se ve se ve y lo de teams tapa algo o se ve se ve bien yo lo veo bien no sé el resto perfecto vale genial Bueno antes de empezar no sé si se nota pero ando bien resfriada así que bueno espero que sí y pueda hablar bien este ratito Entonces sí como decía Marian os voy a hacer esta pequeña presentación de reproducibilidad y ciencia abierta que bueno Esto no
(00:50) implica nada de código de momento es más para bueno dar una idea de lo que de lo que es ciencia abierta y las acciones que puede implicar Y bueno ya me presento un poco Marian pero yo soy Laura actualmente soy investigadora postdoctoral entre la universidad de utrece que en los Países Bajos y el centro imedea en España en mallorca y originalmente soy de Barcelona y Bueno luego del otro tutorial pero yo trabajo más con python
(01:21) entonces vale un poco lo que vamos a ver durante esta presentación primero de todo que queremos decir con conciencia abierta luego un poco Qué acciones se pueden llevar a cabo y algunos ejemplos yo os daré un ejemplo de con lo que trabajamos un poco aquí en el equipo de nutre que uno es el software de uso en Parsons y otros son actividades de divulgación Y entonces Bueno también decir que bueno este gelcatón también es un claro ejemplo de ciencia abierta y
(01:55) luego algunos consejos prácticos sobre reprodulidad que bueno es algo subjetivo entonces También estaría bien que fuera un poco una que los participantes también dierais un poco de vuestra opinión de cosas que os funcionan bien Entonces sí para empezar que es la ciencia abierta no entonces diferentes personas lo definen de diferentes maneras pero aquí seleccionando dos una sería cinco tipos de abierto que
(02:25) implicaría código abierto por ejemplo compartir el código en github Hardware libre acceso abierto por ejemplo artículos científicos datos abiertos también que estén como en un repositorio online y también recursos educativos abiertos no que sería la vez También este nuestro repositorio de github por ejemplo de este jacatón implicaría tanto recursos educativos como código abierto y luego también hay otra manera en que
(02:55) lo defines es como cuatro sombras de abierto uno sería el acceso abierto a datos que respondería la pregunta podemos realmente conseguir esos datos de manera fácil y gratuita luego el consumo abierto si se pueden usar fácilmente porque hay veces que no sé si alguna persona le ha pasado de que están los datos brutos en línea pero luego para usarlos si no hay una buena documentación detrás que explique el control de calidad u otras cosas pues no los podemos
(03:30) realmente consumir producción abierta se puede contribuir por ejemplo esto sería no tanto los datos pero por ejemplo en el código No si es un código compartido si alguien puede fácilmente contribuir a ese proyecto por ejemplo Y luego el proceso abierto si se puede ver De dónde viene todo que a veces el código los datos están ahí pero no sabemos realmente el porqué de algunos pasos o igual está el código pero no
(04:03) sabemos De dónde vienen los datos que usan Pero bueno Esto es una vista general ahora veremos algunos ejemplos más más concretos entonces un poco el concepto de ciencia abierta que implica No aquí podría ser como que haya dos personas que pueden empezar creando un código que este código se pueda compartir compartir que la otra persona lo pueda reusar y modificar compartir otra vez y usar Entonces sería un poco igual parece un
(04:36) poco confuso pero es todo este bucle así en el que pueda haber esta interacción de tanto alguien crear un código y compartirlo de manera que se pueda reusar y modificar fácilmente y al revés que alguien lo pueda usar y luego dar sus feedback y modificarlo y que haya todo esta interacción en continuo y puede ser un código o puede ser por ejemplo al escribir una una tesis no que a veces hay como este feedback del supervisor o supervisora o un artículo
(05:13) y vale Y antes de seguir y me gustaría saber que Qué actividades creéis que se realizan en vuestro lugar de trabajo donde estéis realizando vuestros estudios en relación a la a la ciencia abierta estaría bien si podéis pensar algunos o compartirlos en el chat yo desgraciadamente no lo puedo ver como estoy aquí compartiendo pantalla pero si queréis poner algunos ejemplos en el chat estaría bien y luego os volveré a hacer esta pregunta después de
(05:51) haberos presentado algunos ejemplos y ver si se os ocurren más más cosas Pero bueno si alguien también quiere compartir alguna alguna actividad de ciencia abierta que realicen en el en el centro también lo podéis hacer ahora para así interaccionar Un poco y que no se esté yo solo Hablando ahora Bueno yo voy apuntando Si quieres lo que vayan poniendo en el chat de momento no hay ningún comentario pero os animo a
(06:27) todos a que respondáis si hay algún alguna actividad de ciencia abierta en vuestro trabajo Bueno si no podemos volver a ver de aquí un momento que otras ideas os pueden ocurrir igual queda todo un poquito más más claro Mira Laura Eugenia dice informes científicos súper si alguien quiere hablar en lugar de escribir también entiendo Jorge Cornejo dice Yo hice mi postdock en fas donde el objetivo es hacer que todos los grupos de trabajo lo hagan como ciencia abierta
(07:20) darlín hermosilla en mi caso Yo estudié una maestría en Data Science que es principalmente con el uso de todo tipo de ciencia abierta no sé si buscabas algo más concreto o no Yo creo que era para saber creo que está bien siempre ver qué hacen las otras personas relacionado a esto y ver un poco que a mí también pasó la primera vez que hay cosas que igual tenemos muy interiorizadas que son de ciencia abierta y a igual hay otras que que no tanto pero bueno veremos igual todo el mundo ya sabía un poco de todas
(07:54) las diferentes acciones o si alguien descubre cosas nuevas hay alguna otra actividad María no pasó no de momento los comentarios al respecto Vale gracias Bueno pues aquí hay algunos justo Rubén Alfredo Alarcón dice informes científicos y reportes técnicos públicos que ya habían comentado también sí Ah genial Perfecto Bueno ahora lo volveré a preguntar de aquí unas diapositivas a ver si hay más ideas a compartir entonces Bueno hay
(08:29) diferentes como caminos no hacia la ciencia abierta por poner un poco el ejemplo aquí en la universidad de utreck ahora relativamente hace poco se quiere ir más hacia la ciencia abierta con el objetivo final de trabajar un poco todos de manera más más conjunta entonces hay diferentes impactos que se pueden tener en cuenta no y uno es el impacto de la ciencia que puede ser no solo el impacto que tenga un artículo
(08:59) sino también por ejemplo actividades de divulgación luego la transparencia detrás de un estudio científico la y también este aspecto un poco más social dentro del mundo del trabajo no que sería por ejemplo la de reducción de la diferenciación entre el personal académico y de apoyo y la multidisciplinariedad y equipos inclusivos el acceso abierto a los resultados trabajo en equipo involucrar a la sociedad nuevos
(09:32) criterios de evaluación eso Por ejemplo que aquí lo que han cambiado en la universidad es que no quieren solo evaluar al personal investigador con Cuántos árticos artículos publican sino por ejemplo también cuántas actividades de divulgación realizan o cuánto código han abierto publican y luego también el factor de Liderazgo mente abierta en el en el currículum por ejemplo adaptando las clases que se dan en la universidad a nuevos tecnologías
(10:10) compartir datos y código que eso lo vimos y luego cooperación en vez de competición que por ejemplo este hakatón también sería un ejemplo de ello y luego pasando un poco acciones más concretas Pues habría diferentes categorías una podría ser la publicación No que creo que es la que más conocemos todos y todas y dentro de eso podría podríamos incluir el uso de licencias abiertas publicación en acceso abierto uso del
(10:44) pie review abierto o sea que se pueda ver este intercambio de los revisores cuando se manda un artículo y también compartir los por ejemplo no esperarnos a tener la versión final de un artículo de un reporte científico sino compartir esa versión más preliminar en diferentes sitios por ejemplo existe arcid.org luego está la divulgación que podría ser tanto comunicación vía redes sociales pero también el compartir los pósters y
(11:17) presentaciones que damos que anualmente eso igual tenemos más intrínseco compartir artículos pero igual no este otro material que presentamos en congresos o en actividades también más divulgativas por ejemplo un colegios luego la evaluación lo que comentaba antes de una evaluación alternativa al personal luego la escritura Entonces por ejemplo el usar el Júpiter como usaremos durante este hackazón o una redacción en abierto por ejemplo existe una página web que se
(11:54) llama overlift que se puede compartir muy fácilmente o como por ejemplo Google docs sería algo parecido luego el análisis sería como compartir protocolos y flujos de trabajo por ejemplo gente que realiza trabajos en laboratorios el compartir por ejemplo los los notebooks el código como ya hemos comentado el compartir datos Y perdón salen hay que otras cosas y que forman parte de la de la búsqueda entonces también dentro de esta búsqueda
(12:32) sería comentar abiertamente diferentes materiales y el uso de bibliotecas de referencias compartidas por ejemplo no sé qué usar usáis las diferentes personas pero podría ser el dependiendo del referente bibliográfico q6 por ejemplo rotero o mendeley pues compartir estas referencias con el equipo de una manera pública y luego también otra cosa que es interesante que Perdón no me salía la traducción al español que sería el compartir las las gran proporción o
(13:07) sea los proyectos que se escriben para tener financiación para proyectos esto también sería una práctica de ciencia abierta que se podría compartir para Sí para otra opción de ciencia abierta y luego eso como veis hay como un abanico muy grande de acciones y igual las que se presentaban anteriormente eran más conocidas Pero hay otras igual un poco más alternativas que podrían ser por ejemplo editar artículos en la en la
(13:40) Wikipedia sobre temas científicos reclamar crédito por la revisión de artículos con el mente esto se hace de forma anónima pero una vez acabada esta revisión se podría reclamar Pues el trabajo hecho en esa revisión comunicar los resultados analizados con tanto personas expertas como no expertas y al público en general no O sea participar en un programa de televisión y radio explicando los resultados de algún estudio que se realizó esto por
(14:13) ejemplo haría parte de la ciencia abierta y bueno Esto también ya se el compartirlo en redes sociales y no solo compartir el trabajo de uno o una misma pero también reaccionar al trabajo de otras personas luego presentar en colegios el usar el software abierto por ejemplo el usar por ejemplo python en vez de matlab que es más fácil la que todo el mundo pueda acceder a ello y luego hay otras acciones que forman un poco más
(14:45) parte de la de la diversidad en ciencia no que podría ser por ejemplo negarse a participar en paneles científicos en los que solo hay hombres o personas blancas y luego también el Traducir el material científico a otros idiomas ya que la mayoría de este material que encontramos normalmente está en inglés no y bueno ahora pasando un poco a lo a los ejemplos bueno como dice Bueno en la expresión que al menos usamos lo de
(15:17) barrer un poco para casas y que os comparto un ejemplo de que usamos aquí en el equipo que es el ejemplo de lotion parcels y que es este este software pues es un lo que haces es un simulador lagrangeano para el seguimiento de partículas en la animación en la derecha veis un pequeño ejemplo aquí con las las partículas de colores y lo que significa parcels es una abreviación Bueno es un poco extraña pero es probablemente un simulador la garantía no muy eficiente constitucionalmente y bueno eso es un
(15:53) código en python que consiste en un conjunto de clases y diferentes métodos para poder modelizar el desplazamiento de partículas Y qué concepto hay detrás al concepto detrás de este software en abierto es que escribir un buen código pues es difícil no entonces todas las personas científicas a menudo nos centramos en resolver un problema a veces muy concreto y en cambio este software un software científico queremos que sea con
(16:28) este concepto de ciencia abierta se construye poco a poco y no y tampoco y no nos centramos tanto en un diseño muy general y lo optimizar el código suele ser algo que se nos ocurra A última hora Cuando lo estamos ejecutando y también otro concepto importante es que a veces Pues bueno por qué deberíamos no las personas científicas a verlo todo sobre la ingeniería informática verdad Creo que bueno el los diferentes participantes tenéis
(17:02) todos como pues backgrounds muy muy diferentes pero en general eso no somos personas que hayamos estudiado ingeniería informática entonces Pues habrá un límite no de Hasta qué punto podemos desarrollar un buen software pues ahí entra también este punto de multidisciplinariedad que mencionaba antes como acción de ciencia abierta de pues involucrar tanto a personas científicas como analistas numéricas y también personas expertas en
(17:32) programación y poder un poco atacar este problema desde un punto de vista más multidisciplinar porque Bueno creo que el punto importante es que claro Nadie puede saberlo todo desde ciencia de alto nivel en el mundo académico hasta todas las particularidades de optimización de código entonces Bueno pues se creó este software con esta colaboración entre distintas personas y aquí veis otro ejemplo como diferentes personas se
(18:03) centran en diferentes tareas Dentro de este de este código por ejemplo un compañero se centró en crear este código que lo que habéis en el animación a la derecha es poder crear un poco de interacción entre partículas entonces las partículas azules se mueven pasivamente pero las las partículas rojas atraen a las partículas azules no entonces una vez que las partículas están dentro del círculo rojo pues tendrán tendencia a quedarse ahí pero bueno Esto es solo un
(18:38) ejemplo de una aplicación más concreta gracias Pues a la interacción de diversas personas y bueno este software se pastels gracias a este concepto de ciencia abierta pues es usado extensamente y bueno para daros un ejemplo de poco motivación de Por qué ciencia abierta Pues gracias a ello Pues de 2017 se han publicado más de 80 artículos donde han usado este código y es usado por al menos una docena de grupos de investigación alrededor del mundo de diferentes disciplinas desde el más Ecología y
(19:19) biología hasta otras cosas más distantes como en temas de arqueología también hay una gran interacción en el kit up con más de 400 issues y Gracias también a que tiene una licencia del tipo mighty que es la más permisiva también esto ayuda a que a que pues sea usado por más personas Pero bueno no no es solo da como buenos métricas en plan muchos artículos y demás cosas sino que gracias a que está siendo abierto y es fácil de usar muchas personas de diferentes partes como se ve
(19:58) un poco más o menos aquí esto Solo para enseñar todos los diferentes usuarios que han contribuido al desarrollo de este software entonces hay muchas personas del equipo que tenemos aquí pero también personas externas entonces también ayudan a avanzar el código no solo con el personal existente sino también con personas de otras instituciones Y luego el segundo ejemplo un poco lo de divulgación no lo que compartía antes de de compartir los resultados científicos
(20:29) en redes sociales en nuestro caso aquí tenemos una página de Twitter del equipo y lo usamos para intentar al menos cada semana compartir algo aunque sea una pequeña animación de un resultado preliminar para hacer tanto una función no de como compartir ciencia con colegas de la misma área de investigación pero también un poco para el público en general y esto pues ayuda un poco pues eso a otra acción de
(21:01) ciencia abierta y luego otro ejemplo que os quería Mostrar era es por ejemplo algo también más divulgativo para ejemplo trabajar con colegios esta página web que se llama Plastic a ver si se ve que en lo que consiste en por ejemplo pues poder mostrar a los niños y niñas en colegios y clicamos aquí soltáramos un patito de goma en este punto Cuáles sería la zona más probable donde podríamos luego encontrar el pato no entonces pues se muestra aquí las
(21:40) diferentes zonas y aquí arriba el tiempo transcurrido entonces hay esta tarea también un poco de relacionar Pues el código no abierto con aplicarlo un material divulgativo que podemos usar fácilmente con niños y niñas para mostrarles un poco el impacto por ejemplo de la de la polución y bueno y el último ejemplo sería pues este jacatón no entonces este jacatón viene motivado por la por la ciencia abierta y también hay otras iniciativas como sería el Ocean software Campers
(22:21) que lo comentó Marian que en nuestra compañera de anís trabaja en esta comunidad y por ejemplo el año pasado fue la primera vez que realizamos una versión en español de lotion tanto en presencial en Perú como virtual y la idea era un poco pues crear material en español tener más ejemplos en otras regiones del mundo y también pues promover la colaboración entre países hispanohablantes Que obviamente pues esto también se aplicaría esta motivación a este salcatón
(22:59) Y bueno pues aquí después de haber dado pues bastantes ejemplos Pues si quería volver a lanzar la pregunta de si se les ocurría Pues algún otro ejemplo de acción de ciencia abierta que realizarán Pues en su lugar de trabajo o de estudio bueno otra vez si se os ocurren más ideas se pueden comentar en el chat o decir o activar el micrófono y decirlas te comento Laura dos comentarios de hace un rato de Jorge Cornejo él decía que
(23:37) suele usar github y erre macdown para todos sus informes y también habla de una plataforma que yo no conozco speakertech No sé si nos quiere comentar Qué es exactamente yo no la conozco speaker deck sí es una página web básicamente una plataforma donde uno puede compartir presentaciones y cosas por el estilo es bastante útil interesante Ah sí genial sí la que conozco así parecida sería la de fischer pero si no también a veces en Resort
(24:10) Gate gente también comparte presentaciones Pero sí hay varios ejemplos no para cada para cada diferente acción de ciencia abierta que podemos realizar y creo que sí a veces lo más sencillo es ver cuál es la más práctica para para cada persona y sí intentar realizarlo todo paso a paso Laura nos pregunta Judith cams que es sobre las presentaciones donde se pueden encontrar los grandes propósitos que la gente ha compartido Sí eso creo que en el en el PDF hay el
(24:52) enlace ahí el enlace para en el si en el enlace al PDF que hay en el kit up creo que ahí sí que se podría explicar en los diferentes iconitos que mostraba aquí anteriormente Perdón un momentito Sí aquí hay las los diferentes ejemplos y Debería ser interactivo si no lo verifico después para que para que todo el mundo pueda aplicar y explorar las diferentes herramientas Pero eso son son ejemplos como comentaba Jorge pues por ejemplo para aquí lo de compartir postes
(25:25) y presentaciones Pues el speaker deck no no aparece pero sí lo verificaré después para comprobar que realmente sí en el PDF sea interactivo y todo el mundo pueda explorar las diferentes herramientas Soy Jorge nos ha puesto el enlace al speaker deck que podemos ir viendo todos Laura discúlpame si ya dijiste esto completamente estaba distraído metiendo a gente sé que mencionaste este evento y lo que estamos haciendo como un ejemplo de
(25:59) ciencia abierta pero si acaso no mencionaste esto quería profundizar un poco que todos los materiales que estamos desarrollando son abiertos lo que quiere decir por ejemplo que cada uno de los tutoriales incluyendo este por supuesto el que estás dando pero más específicamente los tutoriales computacionales que vamos a ver por ejemplo los cuadernos de Júpiter o el Dr están en kerhop y los pueden usar en el futuro después de este hackatón para lo que quieran Esa es la intención tanto para su trabajo en sí como para
(26:34) continuar esta diseminación Por ejemplo si creen que hay un tutorial específico que su equipo o un grupo más amplio en su universidad se beneficiaría igual lo pueden usar así como están lo único que lo pedimos es que nos mencionen pero esa es la idea que se vaya diseminando y diseminando y en el mejor caso también se encuentran un error Por ejemplo o una mejoría que se pueden hacer lo ideal es que no nos
(26:59) avisen y lo mejoramos nosotros dentro de la capacidad de tiempo que tengamos y así esa ese beneficio se va ampliando Sí gracias Emilio yo creo que eso es un buen ejemplo no de este como un poco esquema resumen que mostraba antes no que podría ser con este material mismo de este jacatón de que bueno Nosotros hemos creado este material pero bueno por ejemplo también rehusando material Pues de compañeros de lotion hardway o
(27:29) de otras iniciativas de nuestro centros de trabajo y que Claro que eso es un ejemplo de ciencia abierta y que mientras haya ese reconocimiento Que obviamente pues se puede usar pero sí gracias por enfatizar aún más ese ese punto tenéis el enlace a los tutoriales en el chat que de nuevo será parte de la página web y tenéis Hay algún comentario más Marian si no pasó la última parte no así que vale adelante Gracias Vale pues
(28:13) así me Emilio el punto que tenías antes es exactamente tal vez para hacer la pregunta más específica si alguien utiliza software de código abierto y pero vamos allá de eso a la hora de ir a por ejemplo al repositorio de donde se desarrolla ese código abierto que utilizan si hacen preguntas ahí y se hacen sugerencias ya sea de mejoría de la documentación o de mejoría del Software eso en sí es parte del proceso de ciencia abierta si tienen algún
(28:46) ejemplo de eso sería una buena oportunidad Jorge Sí gracias Mira yo yo puedo contar un una pequeña historia que que fue lo que me trajo estar aquí hoy día que hace un tiempo yo estaba buscando en python Cómo acceder a unos datos de un sk80 un transductor oceanográfico no cierto para para obtener datos de de peces y resulta que el equipo que yo tenía era muy nuevo y el y el python no no tenían la capacidad
(29:25) de leer esos datos Y contacté al equipo y resulta que terminé conociendo a Emilio y y conversando Ah Y eso es gracias a la ciencia abierta que Ellos tenían este paquete compartido y y bueno así es como al poco tiempo agregaron las cosas que yo necesitaba y bueno y seguimos conversando y hoy día estoy aquí tratando también de aprender Y y compartir un poco lo que uno sabe por eso esa es la gracia de la ciencia
(29:51) abierta Exacto eso es buen ejemplo Sí gracias Jorge perfecto Bueno alguien más quiere compartir alguna pequeña experiencia Bueno si no pues pasaremos a la última parte y luego al final habrá un poco de tiempo para preguntas Bueno pues la última parte sería un poco consejos prácticos Pero obviamente Esto es algo muy subjetivo Está también basado en un en un tutorial que se dio en inglés en el Ocean hardway pasado por Nick record Y eso son consejos prácticos generales
(30:41) obviamente subjetivos igual le funciona a todo el mundo igual no Y también si podéis ir pensando cosas a medida que les van bien a ustedes para comentarlas al final estaría estaría bien así compartimos un poco todo el mundo no que es lo que nos va mejor que eso también es una parte importante de la ciencia abierta Pues bueno una primera parte sería la documentación y qué quiero decir con eso Pues sería como documentarlo todo que es mucho trabajo
(31:12) pero normalmente nuestro yo del lo agradece muchísimo y esto puede ser sin notas en papel pero también como electrónicas no en el PC entonces en herramientas como evernote o si no el one Note en Windows el programa notes en Mac o luego también puede ser notas interactivas en el r mapdown que mencionaba Jorge o también en Júpiter también se pueden tomar estas en los Júpiter notebooks también se puede como documentar todos los pasos que se van
(31:49) haciendo de esto luego hay otro ejemplo de herramientas de pago Pero bueno aquí ya no sería tanto ciencia abierta verdad y luego también pueden ser simplemente documentos de texto como en un notepad o en procesadores de texto simplemente en Word o Google docs pero pero eso que simplemente pues anotar todo para eso no solo el yo del futuro como decía antes pero también la hora de compartirlo con compañeros y compañeras que igual hay alguna cosa que
(32:23) es como Ah Pues esta parte era complicada para mí y al igual en un futuro vas a volver a usar algo no te acuerdas Y al verlo ahí apuntado pequeñas cosas que ayudan un poco al compartirlo con otras personas y con uno mismo en el futuro no y otra parte sería la organización no ahí es importante pensar cómo se va a organizar un poco Los ficheros antes de empezar un proyecto que esto de documentación organización parecen cosas como muy triviales o simples pero sí que es
(33:00) verdad que a veces llevan mucho mucho tiempo no y pues tres puntos igual importantes a tener en cuenta es como nombres consistentes elegibles por el ordenador por ejemplo los espacios a veces pueden dar problemas y comprensibles humanamente que esto a veces se nos olvida pero a veces ponemos yo que sé archivo ABC porque vamos con prisa y luego si en un rápidamente después no lo corregimos ya no sabemos que es ese fichero para para qué servía
(33:32) no y por ejemplo eso lo que decía antes los espacios a veces pueden dar problemas cuando los usamos para nombrar ficheros y es mejor usar un guión o la barra baja y luego Si se quiere ordenar Los ficheros fácilmente ayuda mucho enumerarlos o usar fechas disculpa por ejemplo aquí veo que tengo algunas erratas o eso usar una fecha así de fechas en formato año mes día que ayuda mucho más a visualizarlo a mí por
(34:05) ejemplo personalmente me ayuda mucho cuando estoy desarrollando un código con Júpiter Notebook pues poner como la fecha de ese día en la que estoy pues probando no porque bueno desgraciadamente los códigos a veces no salen siempre a la primera y así tengo como una versión por por día y no está todo ahí acumulado en un en un solo fichero y luego hacer lo que sea posible para que sea fácil encontrar los datos ficheros documentos figuras por ejemplo
(34:35) ponerlo en carpetas no que quede claro que a veces tenemos ahí las figuras los documentos los datos todo en una carpeta y se vuelve a veces un poco complicado Y eso Y hace que todo se vuelva más fácil para para uno mismo y también para los compañeros o compañeras que lo vayan a usar Y eso no hay respuesta correcta no igual a una persona le funciona También muy bien Esto de ordenarlo por fechas y otra persona no Entonces a veces también es encontrar un poquito de tiempo para
(35:06) ver qué de organización funciona para para un grupo o para una persona individual Y eso aquí hay algunos ejemplos por ejemplo aquí veríamos como lo que ponen Aquí como proyecto no expresivo no que está aquí como todo un poco sin mucho detalles y test aquí cosas antiguas no muy claro y aquí sería lo que se llamaría un proyecto expresivo que claramente Pues bueno aparte de enumerarlo pues separarlo en código
(35:38) datos los gráficos la documentación que en este caso sería no para la redacción de un artículo científico y aquí también habría otro ejemplo de por ejemplo con el que iría por ejemplo en un proyecto de en un repositorio Pero eso son ejemplos que igual uno funciona otro no funciona también para para un grupo por ejemplo de trabajo que eso Igual también Será algo que que todo el mundo irá viendo en sus en sus proyectos de la
(36:10) tarde no y luego automatización con esto es como pensar un poco Qué cosas pueden ser prácticas para desarrollar los métodos no y pensarlo de una manera que sean como partes pequeñas y reusables por ejemplo para limpiar los datos o para crear gráficos para hacer análisis para por ejemplo correr un tipo de simulación como separar cómo estas pequeñas tareas puede ayudar Eso a que sea más fácil organizarlo y también reusar estas
(36:41) partes y luego seleccionar la mejor herramienta no que vaya mejor para para el grupo por ejemplo desde algo tan simple como que se quiere usar python o r no y luego hay veces que bueno que los datos que obtenemos de por ejemplo de medidas in situ pueden estar tomadas en hojas de cálculo y hace y resulta muy útil a veces tener un archivo puede ser como el típico Rigby file de los repositorios kitk o cualquier un documento Word que
(37:18) explique un poco el fichero para poner también un ejemplo concreto eso participe en una campaña oceanográfica y teníamos Ahí todos los datos y algunos así en un Excel Pero bueno la gente que también hace trabajo de campo lo sabrá que siempre hay algún imprevisto el instrumento falla o Y entonces estaba bien tener este archivo ritmi que explicase en plan bueno lunes 27 nos falló el instrumento y por eso hay un
(37:46) hueco entre las 5 y las 6 y que no tenemos datos y pequeñas cosas así que luego pueden ayudar al posterior procesado de los datos luego ya más en la parte de del código en relación a lo que decía desarrollarlo todo en pequeñas partes por ejemplo el intentar usar funciones no en si se crea siempre el mismo tipo de gráfico pues puede ayudar mucho tener una función específica que lo haga Qué bueno se relaciona un poco con el punto de después no el también
(38:23) intentar que por ejemplo un código individual lo haga a caso simplemente el gráfico no que a veces está bien Separar en donde procesamos los datos y donde se crea el gráfico que puede ser que se comparta con un compañero compañera y algo tan simple como Mira no me gusta en azul lo quiero en rojo no que puede pasar a veces pues así simplifica un poco la tarea de solo Modificar el gráfico y correr esa parte del código y no tener que
(38:56) realizarlo todo Y por último sería la diseminación que sería la divulgación y difusión de los datos o de información relacionada al proyecto Y eso que normalmente nuestras investigaciones no las solemos compartir en un formato de artículos científicos y presentaciones orales y pósters y para ello Qué herramientas necesitamos No pues a veces necesitamos como esta lista de bibliografía y para ello también existen
(39:31) herramientas no por ejemplo puede ser rotero o mendeley yo por ejemplo personalmente prefiero que también parece más de ciencia abierta pero hay compañeros que prefieren en mendeley y ayuda eso a gestionar las citas y referencias que hagamos y también a veces ayuda a compartir como toda la bibliografía en mi caso por ejemplo cuando empecé un nuevo tema de investigación Pues el compañero con el que trabajaba me pasó pues en todo el archivo hay de la
(40:03) bibliografía que bueno pues ayuda un poco a reducir el tiempo no de buscar diferentes artículos y otra vez hacer como que sea sencillo el rehacer y modificar figuras que bueno está un poco relacionado con la anterior pero por ejemplo puede ser referenciar el código no se creó la figura No sé en mi caso donde en la aplicación que uso yo para escribir informes o artículos que softwarelift de bajo la figura a veces
(40:35) me pongo como comentario el enlace al código no que a veces no es muy fácil decir Uy esta figura donde En qué código usé no para crearla Pero eso son pequeñas cosas que hace cada uno que va descubriendo que es lo que le funciona mejor Y por último otras cosas en las que pensar Pues eso a veces también hay que compartir nuestros datos no en repositorios en líneas que puede ser tanto para publicar estas bases de datos como con artículos o también porque a veces nos
(41:07) lo pueden pedir desde el proyecto o desde desde la revista donde queremos publicar nuestro nuestro estudio Y eso Y también para que nuestro estudio sea realmente reproducible es importante no compartir los métodos que puede ser compartiendo el código en github o lo que mencionaba antes no de compartir por ejemplo el fulgo de trabajo desarrollado en el en el laboratorio y bueno eso son muchas cosas como decías son
(41:42) cosas subjetivas os he dado ejemplos de igual de lo que yo he ido descubriendo durante estos años que me puede funcionar a mí pero bueno que cada persona encuentra lo que le funciona mejor también a veces Dependiendo el grupo de trabajo se encuentran otras herramientas y bueno no nos queda mucho tiempo pero creo que mejor si hay alguna otra buena práctica que queráis Compartir por el chat creo que Estaría bien para así un poco interactuar entre todos de cosas que nos
(42:15) funcionan o no nos funciona un poco nuestro día a día y para acabar Bueno hay más información aquí en estos diferentes enlaces No he entrado en el tema del github ya que fue algo que se dio en el aula invertida pero aquí tenéis el enlace por si necesitáis repasar un poco get up Y cómo cómo usarlo y luego otros en español y algunos en inglés sobre la ciencia abierta en general pero bueno como habéis visto abarca muchos temas
(42:45) distintos y solo se he presentado unos unos pocos y bueno Estos son algunas de las referencias aquí de esta última parte y agradecer bueno eso como decía Emilio que pues otros compañeros no crean material y está bien que en este concepto esencia abierta pues lo rehusamos y se usa para material nuevo Y bueno ya he hablado yo bastante lo dejo aquí si ahora hay algunas preguntas en respecto a esto a lo que de tiempo y si no en el foro
(43:22) intentaré responder también vale muchas gracias Laura Añadir rápidamente que yo en cuanto a las citas yo uso que también es gratuito y Bueno me parece que es menos popular pero también se usa bastante pero a mí me ha ido muy bien y considerado cambiar pero realmente me he quedado con jarred porque me va bien nos pregunta Judith donde podemos encontrar el PDF entiendo que está todo dentro de tus tutoriales en tu carpeta de tutorial Exacto vale Y bueno no tenemos mucho más
(43:53) tiempo lo único decir que Johnny salas comentaba también algo de un simulador de partículas desarrollado en el cern que entiendo que también es ciencia abierta sí comentar rápido Sí comentar rápido con eso que bueno como decía yo he puesto esos ejemplos al principio porque Bueno eso es más fácil compartir ejemplos que usamos en el día a día no pero por este tema específico de simulador de partículas hay muchos otros
(44:20) software también en que están así compartidos en abierto como Open drift o hay bastantes más así que es solo un ejemplo pero que obviamente Existen varios otros Sí bueno por aquí por el chat están poniendo equivalentes a todo esto que ha ido comentado no Laura y Bueno yo creo que es buen momento Muchas gracias Laura de nuevo creo que está justo en el tiempo así que vamos a aprovecharlo para pasar ya al apartado de Emilio por si surgen problemas en nos va a explicar
(44:50) cómo se entran Júpiter happ y los pasos que tenéis que ir haciendo adelante Emilio